ONU-Habitat se financia principalmente mediante contribuciones voluntarias de los gobiernos y los donantes intergubernamentales. Otros socios, como autoridades locales, sector privado y otras agencias de las Naciones Unidas y organizaciones multilaterales, aportan fondos para programas concretos. Con recursos básicos limitados del sistema de Naciones Unidas, ONU-Habitat depende en gran medida de las contribuciones de los donantes. Las principales fuentes de financiación de ONU-Habitat son:

• Asignaciones del presupuesto ordinario, que son aprobadas por los Estados Miembros de la Asamblea General de las Naciones Unidas. Estos fondos proceden del presupuesto central de las Naciones Unidas. En 2012 se recibió 10.7 millones de dólares (7% del presupuesto total de ONU-Habitat).
• Contribuciones para fines generales, que no son asignados por contribuciones voluntarias de los gobiernos. Estos fondos se asignan de acuerdo a las prioridades aprobadas por el Concejo de Administración de ONU-Habitat. En 2012, ONU-Habitat recibió 10.9 millones de dólares de contribuciones para fines generales (7% del presupuesto total de ONU-Habitat).
• Contribuciones para fines especiales, asignadas por contribuciones voluntarias de gobiernos, fundaciones, sector privado, agencias de la ONU y otros donantes, para la ejecución de actividades específicas definidas en el programa de trabajo aprobado por el Concejo de Gobierno. Estas contribuciones se dirigen hacia la Fundación de ONU-Habitat para la labor normativa y de política, o hacia la cooperación técnica para la ejecución de proyectos en distintos países. En 2012, ONU-Habitat recibió 36,2 millones de dólares (23% del presupuesto total de ONU-Habitat) para las actividades de la Fundación de ONU-Habitat y 128,5 millones de dólares (63% del presupuesto total de ONU-Habitat) para la cooperación técnica en los países.